Em nosso laboratório utilizamos abordagens de bioquímica, biologia molecular e bioinformática para investigar alterações globais no padrão de expressão gênica de tumores humanos. Nosso objetivo é compreender as bases moleculares do câncer, identificar novos biomarcadores para diagnóstico precoce/prognóstico clínico e apontar possíveis alvos terapêuticos. Um foco de interesse é a caracterização funcional de RNAs nãocodificadores de proteína (ncRNAs) expressos no genoma humano. Buscamos através desses estudos revelar novos mecanismos de regulação mediados por ncRNAs que contribuam para a transformação maligna ou a progressão de tumores.

Pesquisador Responsável

 Eduardo Moraes Rego Reis Eduardo M. Reis
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CV Lattes
ORCID


Técnicos


  Bianca Dazzani Marcolino
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Especialista de laboratório


Pesquisador colaborador


  Luís Bruno da Cruz e Alves de Moraes
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Triagem funcional de vulnerabilidades na maquinaria epigenética no câncer de pâncreas



Alunos de Doutorado

Diogo Vieira da Silva Pellegrina Diogo Vieira da Silva Pellegrina
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CV Lattes

Análises integradas de alterações somáticas e transcricionais em tumores de pâncreas

Neste projeto o aluno analisa o sequenciamento do exoma de amostras de tumores de pâncreas, e usa de redes de correlações para compara-lo com os dados de transcritoma a fim de identificar vias moleculares preferencialmente afetadas por alterações somáticas ou trancricionais.

 
Vinicius Ferreira da Paixão Vinicius Ferreira da Paixão
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CV Lattes

Identificação de novos marcadores para o diagnóstico molecular do adenocarcinoma de pâncreas
O projeto foca na identificação de novos biomarcadores para diagnóstico molecular no câncer de pâncreas partindo da análise de dados de sequenciamento de nova geração, tanto de exoma quanto de transcritoma. Outro objetivo é o aprimoramento do método de análise em escala genômica de amostras de tecido obtidas por aspiração ecoendoscópica por agulha fina (EUS-FNA).

  Ester Risério Matos Bertoldi
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CV Lattes
     
Modelagem e implementação de banco de dados clínicos e moleculares de pacientes e seu uso para identificação de novos biomarcadores do câncer de pâncreas
Desenvolvimento de um banco de dados relacional para facilitar a mineração de informações a partir de dados genômicos de câncer de pâncreas gerados por nosso laboratório ou por consórcios públicos a fim de priorizar candidatos para caracterização funcional e avaliação de potencial diagnóstico. 

Ricardo Alberto Chiong Zevallos Ricardo Alberto Chiong Zevallos
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Identificação e caracterização funcional de lncRNAs reguladores da maquinaria epigenética no câncer de pâncreas

Alunos de Mestrado


Arthur Friguglietti Silveira
Arthur Friguglietti Silveira

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CV Lattes

Identificação de RNAs não codificadores longos envolvidos na arquitetura celular de tumores pancreáticos
A cultura de células em monocamada é um dos métodos mais utilizados para o estudo das funções biológicas de células tumorais, porém essa técnica representa pobremente a arquitetura celular dos tumores originais. O objetivo deste trabalho é padronizar um método de cultura tridimensional para linhagens tumorais pancreáticas, buscando identificar RNAs não codificadores longos relevantes para a manutenção da organização celular tumoral.


Alunos de Graduação

Victoria de Paiva Oliveira Victoria de Paiva Oliveira
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CV Lattes

Geração e caracterização de linhagens celulares derivadas de carcinoma pancreático resistentes à gemcitabina
O objetivo do projeto é a geração de linhagens celulares imortalizadas de PDAC resistentes à gemcitabina, e a caracterização molecular desta resistência. Tais linhagens serão geradas por tratamentos prolongados sob concentrações sub letais da droga e terão sua resistência avaliada através da determinação da expressão de genes marcadores de resistência já descritos na literatura por RT-qPCR. Além de linhagens de PDAC amplamente estudadas, será também utilizada uma linhagem derivada de xenotransplante de PDAC, que recapitulam com maior fidedignidade o microambiente tumoral do paciente


Juliana Sayuri Omiya
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Caracterização de RNAs intergênicos expressos em câncer de pâncreas
O projeto busca caracterizar RNAs intergênicos e validar sua expressão diferenciada em células tumorais de pacientes com câncer de pâncreas. A partir dos resultados, pretende-se então silenciar a expressão desses transcritos para o estudo de possíveis alterações celulares, as quais podem ser exploradas para entender a importância da expressão desses RNAs nas células tumorais e no

estabelecimento, manutenção ou progressão do câncer.


Alunos de Ensino médio


Leonardo dos Santos Alixandrino
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Identificação e estudo de um biomarcador associado com o processo de malignidade do câncer de pâncreas




Murilo Dorión
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Aplicação de algoritmo de classificação one-class para identificação e investigação de microRNAs e lncRNAs associados com a desdiferenciação tumoral e agressividade no câncer de pâncreas

Identificar microRNAs e lncRNAs potencialmente envolvidos com o desenvolvimento de fenótipo desdiferenciado do tumor em câncer de pâncreas por meio de um algoritmo publicado para detecção de sinal de stemness (potencial tronco). Investigação funcional in silico dos microRNAs.



ex-alunos


Diogo de Oliveira Pessoa 2019, Mestrado
Omar Julio Sosa 2019, Doutorado
Júlio César G. de Sousa Filho 2017, Mestrado
Ana Luiza Quilici 2017, Iniciação Científica
Nathalia Rocha Lainetti 2016, Iniciação Científica
Gabriel Francisco Zaniboni 2015, Mestrado
Otto Luiz Dutra Cerqueira 2014, Doutorado
Santiago Andrés Vilella Arias 2013, Doutorado
Ana Carolina Tahira 2013, Doutorado
Ana Carolina Ayupe O. Beckedorff 2012, Doutorado
Lauren Camargo 2012, Doutorado
Camila de Moura Friedlander 2008, Doutorado
Glauber da Costa de Brito 2007, Doutorado


Departamento de Bioquímica
Instituto de Química
Universidade de São Paulo - USP

Av. Prof. Lineu Prestes, 748 sala 1208
Cidade Universitária
CEP 05508-000 - São Paulo - SP

Fone: +55-11-3091-2173
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